Está formado por el Hospital Universitario de La Princesa (como núcleo básico del Instituto), Hospital Universitario de Santa Cristina, Hospital Infantil del Niño Jesús, Área de Influencia de Atención Primaria del Hospital U. de La Princesa y la Universidad Autónoma de Madrid. El Instituto de Investigación del Hospital de La Princesa fue constituido el 15 de Diciembre del 2009 en virtud de un convenio firmado entre centros sanitarios de la Consejería de Sanidad de la Comunidad de Madrid y otras instituciones de investigación básica